“纳米核心”第三季上映，金蝰蛇与瑞再次开战

《纳米核心》第三季第一集：阿萨的方舟计划失败，元星现主要势力为金蝰蛇，然而金蝰蛇也想获取元星的能源以及圣柜，所以秘密针对变种人以及纳米尖兵展开了一系列的研究。瑞依旧想复活赫雅，试图打听金蝰蛇掌握的关于圣柜的线索，然而另外一个神秘组织“黄昏使者”也悄然现身。
在第三季的人物细节设计上比前两季都有了较明显的提升，有人说他们都长大了，但不得不说了现在的他们确实没有之前可爱了

前两季人物

第三季人物
本集开端便是金蝰蛇的秘密研究内容，寻找圣柜的线索，对抓来的变种人进行实验，但这种高强度的实验最终以si亡结束

然而城市的保卫队“东安联”对这一实验并不知情，他们只负责抓人出现在城市中的变种人以及其他危险分子，被抓的变种人几乎都被送往了金蝰蛇研究所，部分变种人不愿接受那痛苦的实验，选择了自sha。其实这些变种人都挺善良的，虽然他抓了一个人质，但也是迫不得已而为之，东联安对进入商都的变种人一律实行抓捕政策，变种人看到那个小孩(人质)躲在墙角瑟瑟发抖并哭泣哽咽的时候，他来特意来了一罐饮料准备给那个小孩，可是这时楠队冲了进来，他也只好用武器挟持了小孩，之后变种人和楠队说了关于实验的事情，可楠队并没有相信，最终变种人被抓捕，并套上了一个特质的项圈（可能有抑制变种人能力，并控制其活动能力的功能），但这个项圈却让带上的的人痛不欲生，楠队看着也不忍心，只好将项圈取下来，之后变种人选择了跳楼。

此后由于楠队私自解开项圈，导致他们跟踪了三个月带的变种人自sha，楠队被停职三十天，一个人坐在椅子上喝闷酒（也可能是饮料），但病情突发（病情具体不明，但需要注射一种特殊的药剂才能缓解“这是下集内容”），这时瑞以尖兵的形态出现了，他的目标是机器人的芯片（用来研究金蝰蛇等信息），拿到芯片后瑞便离开了，路上于楠队对视的一眼（这一眼引发了之后不少的剧情），然而此时金蝰蛇也发现了瑞，之前给瑞植入的东西中被做了手脚，在他变身之后可以定位

他们认为纳米尖兵比变种人对他们找到圣柜的线索更重要，于是瑞也成了他们的目标之一。

下集剧透：楠队病情再次突发，药剂用完的她被迫接了一个可以获取药剂的任务，但楠队在执行任务途中遇险，瑞出手相助。